中华民国教育部为建立学校运动联赛制度，提高学校运动水准，因此委由中华民国高级中等学校体育总会积极推动校际运动联赛，以期借由竞赛活动广植运动人口，发掘培训优秀运动人才，并透过运动团队的互动，增进校际情感，蓬勃校园运动风气，充实青年学子校园生活内容，以达成倡导运动风气，提高国民生活品质之目标。

开办初期分为自强联盟和地方联盟，之后才演变为现今的甲乙两级。

106学年度甲级的决赛首度移师台北市立大学天母校区体育馆举行[1]。

108学年度甲级决赛移师台北和平篮球馆举行，因为新冠病毒疫情影响采闭门比赛该阶段赛事全程由FOX体育台提供现场直播[2]。